[romoloman]

Sai che non ho capito che cosa vuoi fare ?
Primo: i segnali sono sincroni (ovvero tutti con lo stesso inizio) oppure sono asincroni ?) Se sono asincroni non funzionerà mai...

Come faccia un sommatore a darti una durata lo sa solo Dio, a meno che tu non lo usi in funzione di integratore ed allora dato un segnale l'integratore ti da un valore che è mediamente proporzionale alla sua durata media.

Perché il circuito con arduino non funzioni non lo so, ma normalmente beccare le durate di un segnale ppm con arduino è più che fattibile quindi il problema è nel codice.
Rimane sempre il problema di come hai fatto il circuito e se i segnali sono asincroni o sincroni (in questo caso sarebbe meglio fossero asincroni). A quel punto vai su un solo pin (tipicamente il 2 o il tre che hanno la possibilità di gestire l'external interrupt) con 4 bei diodi che ti portano il segnale e risolvi così... (il verso dei diodi dipende dalla logica del segnale, attivo alto o attivo basso)