Non ho ben capito se son i file generati da gmfc sbagliati o cosa... Fai "cut to file" dal menù "panel cut" della finestra "cut" ?
Comunque come ti diceva Greg, in cut2g agisci sulle optioni come da figura.
Il file poi puoi darlo in pasto a mach3 per esempio e funziona.
Ciao, fai sapere.