Sicuramente stai parlando di un regolatore per motori brushless, visto che hai collegato tre fili al motore. Il colore non ha alcuna importanza; basta invertire due soli di questi per invertire la rotazione del motore.
Dal lato batteria ci sono du soli fili: rosso e nero(+ e -); anche se sai distinguerli, non è detto che possa sbagliare a collegarli!
Facciamo finta che non abbia invertito la batteria; se hai collegato quest'ultima prima dei fili del motore e qualcuno di questi è andato in corto, ecco spiegato il motivo.
Una volta fatta la frittata, anche se poi fai tutto per bene, vedrai sempre il fumo ogni volta che colleghi la batteria!