Alla fine ho fatto come vedete in foto utilizzando due batterie e non tre.
Ho sdoppiato i cavi del connettore XT60 alimentando da batteria 6s l'ESC skywalker (che alimenterà poi il motore) e contemporaneamente anche il BEC esterno (che invece alimenterà a 6V centralina e servi da BATT1).
La lipo 2s d'emergenza l'ho collegata a BATT2 con voltaggio a 5,5V (entrerà in funzione solo nel momento in cui il V della BATT1 crolla)