[-c3po-]

...collegare due fili di un motore brushless direttamente ad una batteria fa bruciare quasi istantaneamente gli avvolgimenti.

molto probabilmente hai una fase scollegata.
non è facile da individuare,
ma probabilmente uno dei fili che escono dal motore si è tranciato nel crash.
puoi comunque provare a collegare il motore direttamente all'esc,
giusto per escludere altre interruzioni.

al limite puoi collegarlo al posto del motore principale,
per escludere che sia l'esc.