non c'è nessun problema a parallelizzarle visto che sono della stessa capacità(ma comunque non importante) e stessa carica
pensate al caso limite quando colleghiamo in parallelo le batterie di due macchine per avviare quella rimasta a terra, una è completamente scarica, l'altra ha pure l'alternatore in funzione ma non scoppia nessuna delle due
quello che vedo più difficile è collegarle da serie a parallelo per ogni carica e da parallelo a serie per ogni utilizzo...