Se con le 4 celle non va e con le 5 si allora il problema è quello!
Forse quando hai provato con Li-Po e regolatore a 6 V non erano sufficienti e magari quel mezzo Volt in più di una 5 celle ben carica rispetto ad un regolatore 6 Volt spaccati potrebbe esserne la causa, forse centralina molto affamata di corrente
Comunque non c'è dubbio che un problema così intermittente e secco sia di natura elettrica
Saluti
Luca