Si puo' scrivere su EEPROM programma anche su atmega, il problema e' che a differenza della EEprom classica (100Kcicli scrittura) la EEprom Programma supporta solo 10000 cicli scrittura che possono essere comunque tanti....
Su Atmega pero' si trovano gia dalla ver 32 le librerie per scrivere su memoria SD(secure digital) in modalita' fat16 quindi ribalti tutto su pc ed hai gia il file di testo

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Io ti consiglio di usare la memoria EEprom dati per quel 1K che serve e lasciar stare la eeprom programma che ti permette di metterci ben altro

libreria fat inclusa e poi vuoi mettere la comodita' anche solo 16Mb SD