Ho avuto recentemente una esperienza simile con un motore cassarotanre Turnigy, dava l'impressione di vibrare anche senza l'elica.
In oltre sotto sforzo scaldava in modo incredibile tanto che si è bruciato dopo 40 secondi di volo!!!

la mia tesi è che uno o più avvolgimenti non erano uniformi i quali generavano degli squilibri.
Forse il tuo motore ha lo stesso problema!

in tal caso mettiti il cuore in pace e sostituiscilo.