[Alvar]

Prova a sfilare gentilmente il terzo cavetto rosso. Non dovrebbe essere collegato a nulla. Probabilmente viene utilizzata la stessa spinetta per le batterie 2s e 3s. Il nero è collegato al negativo della prima cella. Il primo rosso al positivo della prima e al negativo della seconda. Il secondo rosso al positivo della seconda. Per caricare solo la seconda cella (non so se il tuo caricabatterie preveda questa funzione...) la tensione andrebbe applicata teoricamente tra il primo rosso (-) e il secondo rosso (+)
Comunque.
Hai provato a misurare la tensione dai cavi principali della batteria? Ti dà 2,83 o circa il doppio?
Se la misura è 2,83 significa che la seconda cella è andata. Se invece il voltaggio è circa doppio significa che il cavo di bilanciamento si è dissaldato dalla cella.