Tagliare il programmatore.
 

Vorrei lasciare il programmatore dell'atmel dentro alla radio. é possibile pilotare con la batteria 3s della radio dei relè da 12V normalmente chiusi in modo che quando accendo la radio e dò corrente la batteria vada a eccitare i relè che interrompono i fili del +5v, mosi, miso ecc.. che vanno al controllore? Questo dovrebbe proteggere il programmatore da eventuali danni fatti cercando di programmare la radio lasciandola accesa.

danni non ne fai, se vuoi evitare problemi di programmatore acceso, metti semplicemente un diodo schottky sulla linea che dal programmatore va al 5V

Ricevuto, quando mi capita di potermene procurare uno lo posso anche inserire, ad esempio un 1N5817 potrebbe andar bene?
Però se mi dici che non è possibile fare danni in alcun modo sarebbe un'operazione inutile ed eviterei di farla.
In effetti al diodo avevo pensato anche io però avevo paura che la caduta di tensione potesse rendere troppo bassa la tensione al controllore. Anche un diodo schottky ha una sua caduta di tensione, il 1N5817 dovrebbe tagliare 0.45V se non erro.

Guardando la curva caratteristica credo 0.3V o anche qualcosa meno...
Considera che i 450mV sono a 1A ...
Il microprocessore e il display quando assorbono 100mA assorbono tanto...

Oppure cerca questi: http://www.rectron.com/data_sheets/fm120l-140l.pdf